More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1873 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  58.16 
 
 
162 aa  180  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.15 
 
 
162 aa  170  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 
160 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 
167 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
150 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
150 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
163 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
157 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 
154 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
153 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
145 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
170 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 
164 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
145 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
153 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
170 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
170 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
145 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
149 aa  117  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  35 
 
 
162 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
145 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
145 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  38.13 
 
 
162 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
154 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
158 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
150 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
151 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  40.83 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  35.46 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  37.88 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
153 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  33.81 
 
 
155 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  33.81 
 
 
155 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
151 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 
151 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  34.94 
 
 
173 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 
168 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
148 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
152 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
156 aa  103  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
149 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
149 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
149 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
149 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
159 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
153 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.46 
 
 
187 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 
152 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  33.56 
 
 
155 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  35.11 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  34.78 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  34.78 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
150 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
150 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  32.61 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>