More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1274 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  100 
 
 		 127 aa  246  6e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3984  ribosomal protein L24  64.35 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  51.3 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  47.79 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  48.67 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.7 
 
 		 106 aa  98.2  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  45.24 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  46.9 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  46.4 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  46.96 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  46.09 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  46.96 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  46.9 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  46.96 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  48.67 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  44.92 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  40.94 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  47.41 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  47.86 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  42.02 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  41.41 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  42.34 
 
 		 102 aa  90.1  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  43.44 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  42.74 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  43.59 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  43.59 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  45.53 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  38.4 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  44.25 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  41.88 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  46.9 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  43.97 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  43.97 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  43.86 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  47.79 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  51.61 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  41.74 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  42.74 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  48.39 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  38.14 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  42.24 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  50.54 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  40.52 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  46.99 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  39.83 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  46.24 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  41.03 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  49.46 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  41.07 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  45.3 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17263  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  38.94 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  38.53 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  41.88 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  38.98 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  45.78 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  40.68 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  41.03 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  40.68 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  38.98 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  40.17 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  37.19 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  40.34 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  39.47 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  41.13 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  45.87 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  43.86 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  40.57 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  39.62 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  40.35 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4679  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000175822  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  39.62 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  42.24 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  39.62 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  39.62 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  41.03 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  39.62 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>