More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2294 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  74 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  72.88 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  73.33 
 
 		 304 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  59.72 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  59.72 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  60.42 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  55.99 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  54.42 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  52.63 
 
 		 296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  56.11 
 
 		 304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  56.6 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  54.45 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  56.78 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  53.68 
 
 		 317 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  51.79 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  54.61 
 
 		 295 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  54.98 
 
 		 295 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  48.76 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  52.45 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  52.8 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  54.32 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  49.28 
 
 		 300 aa  254  9e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  52.8 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 308 aa  238  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  45.2 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  48.76 
 
 		 309 aa  234  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  45 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  42.35 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  45.36 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  41.35 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  39.37 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  40.35 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  42.8 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  41.64 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  40.62 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  40.51 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 		 330 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  39.4 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  35.79 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  39.41 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  41.73 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  39.48 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  38.25 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  37.73 
 
 		 328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  35.47 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.54 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  33.84 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.33 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  33.21 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  32.7 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.84 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  31 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  31.58 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  31.44 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.22 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  31.39 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  31.39 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  31.39 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  31.87 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  31.39 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  31.39 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  31.39 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30.71 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  31.02 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  31.39 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>