298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1173 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 110 aa  214  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  71.82 
 
 		 113 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  69.09 
 
 		 113 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  68.18 
 
 		 113 aa  151  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  70.54 
 
 		 115 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  59.09 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  63.3 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  61.68 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  55.96 
 
 		 111 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  57.8 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  69.66 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  58.72 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  70.54 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  58.72 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  55.96 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  62.64 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  64.86 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  57.14 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  58.18 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  55.43 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  58.7 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  58.43 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  51.58 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  51.82 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  55.43 
 
 		 94 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  56.47 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  59.09 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  56.47 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  55.29 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  55.29 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  48.86 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  49.04 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  48.08 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  47.57 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40.34 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  47.12 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  47.12 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  51.76 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  44.76 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  46.23 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  47.12 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  42.24 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  47.17 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  43.93 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  46.23 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  43.62 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  45.88 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  41.58 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  41.51 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  44.23 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  43.96 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  43.93 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.27 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  43.93 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.78 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  35.78 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  35.78 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.78 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.78 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>