More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0808 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
214 aa  427  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  81.31 
 
 
214 aa  356  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  75.23 
 
 
214 aa  324  6e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  75.23 
 
 
214 aa  323  9e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  42.57 
 
 
442 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  41.3 
 
 
442 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  41.58 
 
 
442 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40.98 
 
 
442 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  41.3 
 
 
442 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40.22 
 
 
442 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  42.25 
 
 
448 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.32 
 
 
449 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  43.96 
 
 
445 aa  148  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  45.2 
 
 
214 aa  148  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  41.49 
 
 
459 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 
448 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  41.46 
 
 
443 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  43.46 
 
 
442 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40.85 
 
 
444 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  41.49 
 
 
447 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 
447 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 
452 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  45.71 
 
 
547 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.5 
 
 
213 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
208 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
212 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 
211 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.5 
 
 
205 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 
200 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  37.95 
 
 
197 aa  104  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
222 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.97 
 
 
222 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34 
 
 
202 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
204 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
209 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
200 aa  101  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
207 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.17 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  36.68 
 
 
198 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
207 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  34 
 
 
253 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.84 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.84 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.01 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.01 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  33.5 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
207 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  32.76 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.18 
 
 
203 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  32.18 
 
 
203 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 
203 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
201 aa  92  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 
241 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  38.24 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.52 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.86 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
591 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  44.63 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.36 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
197 aa  89  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
228 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 
215 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 
215 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  32.57 
 
 
202 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>