68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  51.76 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  48.75 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  49.37 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  43.3 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  44.05 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  49.28 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  40.82 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  40.4 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  40.4 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  46.67 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  43.75 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.68 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  43.66 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.75 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  42.35 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  37.38 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.3 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  41.44 
 
 		 524 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  46.48 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  47.46 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  46.48 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.67 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  47.14 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  42.25 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  52.73 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  40.58 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  40.74 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  40.74 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  35.71 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  40.85 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  36 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  45.07 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  35.9 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  40.85 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  40.85 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  47.89 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  28.95 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  28.57 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  37.68 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  40.3 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  39.13 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 243 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  30.77 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  30 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  28.17 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  38.03 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  34.72 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  35.21 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  43.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  35.62 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  31.88 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  28.99 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  37.14 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  31.88 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1229  protein of unknown function DUF448  44.07 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  36.62 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  32.18 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  28.75 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  41.38 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  30.43 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>