62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1229 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1229  protein of unknown function DUF448  100 
 
 
87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1161  protein of unknown function DUF448  98.85 
 
 
87 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1101  hypothetical protein  95.4 
 
 
87 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  65.52 
 
 
87 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  47.56 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  47.37 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  43.06 
 
 
98 aa  60.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  53.03 
 
 
130 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  52 
 
 
120 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  52.31 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  51.32 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  44.74 
 
 
110 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  50 
 
 
524 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.03 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  45.12 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  41.98 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  47.95 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  47.95 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  47.95 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  50 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  47.14 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  46.77 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  43.94 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  47.3 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  56.14 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  47.22 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  36.71 
 
 
92 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  33.75 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  47.06 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  52.73 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  38.27 
 
 
226 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  42.25 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  42.11 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  47.76 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  37.88 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.11 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  44 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  44.29 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  34.57 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  34.57 
 
 
88 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  45.07 
 
 
104 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  42.25 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  37.31 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  36.51 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  39.77 
 
 
247 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  35.94 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.81 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  38.1 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  36.71 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  39.77 
 
 
247 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  37.5 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  32.1 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  36 
 
 
197 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  40.91 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  32.5 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  39.71 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  42.86 
 
 
210 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  34.85 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1235  hypothetical protein  38.75 
 
 
93 aa  40  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000252033  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  37.93 
 
 
243 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  41.43 
 
 
240 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>