29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2432 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  74.32 
 
 		 83 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  60.29 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2413  hypothetical protein  52.31 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  50.77 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  47.27 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.27 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  49.06 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.67 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  49.12 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.3 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  45.28 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  39.62 
 
 		 90 aa  42  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  37.88 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  42.59 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  49.09 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  42.65 
 
 		 234 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  36.23 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  41.07 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  41.51 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  38.24 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  39.06 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  39.06 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  44.44 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>