22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2413 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2413  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  52.31 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  46.27 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  44.78 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  39.19 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  38.33 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  38.81 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  41.07 
 
 		 179 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1494  hypothetical protein  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  39.68 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  46.81 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.38 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  38.33 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  37.31 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  37.31 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  37.31 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  36 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  33.87 
 
 		 108 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>