More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  150  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  147  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 100 aa  140  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 		 89 aa  136  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  136  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  75.86 
 
 		 90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  73.26 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  133  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  75.9 
 
 		 88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1517  ribosomal protein S15  85.39 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3955  ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  66.28 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0783  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1067  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.325142  normal  0.0149181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3325  ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3556  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1380  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  58.62 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1338  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00957832  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 88 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1188  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>