More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  66.47 
 
 		 332 aa  434  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  65.85 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  64.85 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  60.62 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  62.15 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  60.42 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  43.56 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  42.09 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  43.11 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  41.01 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  39.08 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  38.68 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  38.87 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  39.51 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  38.05 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  37.62 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.23 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  33.53 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  36.39 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  32.93 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  33.13 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  32.93 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 360 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  32.02 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  30.43 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  31.93 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  33.96 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  31.42 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  32.38 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  36.44 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  31.23 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  30.74 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  32.61 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  30.42 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  29.65 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  29.36 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  26.87 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  28.27 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 307 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.98 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  30.12 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  28.43 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.54 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  39.06 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.43 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.68 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  28.43 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.18 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.68 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  30.41 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  29.43 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.97 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  28.83 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.87 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  32.94 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  26.58 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>