228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  81.13 
 
 		 164 aa  267  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  80.62 
 
 		 165 aa  263  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  78.88 
 
 		 167 aa  259  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  76.1 
 
 		 165 aa  254  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  71.07 
 
 		 163 aa  232  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  69.57 
 
 		 167 aa  221  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  66.04 
 
 		 163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  68.32 
 
 		 164 aa  213  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  67.3 
 
 		 162 aa  213  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  68.75 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  63.12 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  67.5 
 
 		 163 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  62.5 
 
 		 165 aa  206  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  66.88 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  65.41 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  61.88 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  65 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  64.38 
 
 		 163 aa  204  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  64.38 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  62.5 
 
 		 163 aa  200  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  64.15 
 
 		 162 aa  199  9e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  59.38 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  59.38 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  59.38 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  60.62 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  58.13 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  60 
 
 		 163 aa  191  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  60 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  58.49 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  55 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  55.62 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  56.25 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  56.88 
 
 		 164 aa  180  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  55 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  54.72 
 
 		 162 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  47.17 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  45.28 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  44.65 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  47.8 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  44.65 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  45.91 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  45.34 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  44.65 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  44.03 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  42.14 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  42.14 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  43.48 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  40.88 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  44.1 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  40.37 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  41.51 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  39.62 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  39.62 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  41.61 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  37.74 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  38.99 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>