260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1107 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  97.27 
 
 		 330 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 330 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  96.36 
 
 		 330 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  90.61 
 
 		 330 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  76.67 
 
 		 331 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  74.92 
 
 		 326 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  73.94 
 
 		 326 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  73.64 
 
 		 326 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  74.02 
 
 		 326 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  60.54 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  58.54 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  58.2 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  55.43 
 
 		 335 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  61.82 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  62.54 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  57.1 
 
 		 348 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  58.96 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  57.49 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  53.47 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  53.47 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  53.56 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  53.47 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  53.47 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  53.47 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  56.52 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  57.49 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  57.84 
 
 		 325 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  57.49 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  57 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  57.49 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  47.46 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  54.73 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  53.73 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  49.76 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  51.43 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 		 369 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  46.59 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.43 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  45.63 
 
 		 410 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  47.06 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.43 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  41.77 
 
 		 418 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.83 
 
 		 429 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  41.43 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  46.57 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.57 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  43.2 
 
 		 410 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  47.64 
 
 		 240 aa  180  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  44.61 
 
 		 408 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.04 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  46.57 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  44.17 
 
 		 406 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 		 404 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  45.32 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  43.69 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  45.63 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  39.78 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  43.88 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.41 
 
 		 435 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  45.15 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  43.97 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  43.97 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  45.15 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  42.57 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  43.96 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  43.48 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  43.14 
 
 		 398 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 454 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  39.16 
 
 		 568 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  43.2 
 
 		 278 aa  162  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  43.48 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>