More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0341 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  97.9 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  91.6 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  85.41 
 
 		 234 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  83.11 
 
 		 226 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  84.38 
 
 		 227 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  84.3 
 
 		 245 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  83.41 
 
 		 245 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  83.41 
 
 		 245 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  69.51 
 
 		 224 aa  327  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  70.4 
 
 		 225 aa  325  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  68.95 
 
 		 230 aa  324  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  64.13 
 
 		 224 aa  304  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  65.02 
 
 		 224 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  61.8 
 
 		 229 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  63.51 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  63.51 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  63.51 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  63.96 
 
 		 233 aa  298  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  62.33 
 
 		 224 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  61.43 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  65.47 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  58.74 
 
 		 228 aa  288  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  59.46 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  281  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  59.46 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  59.46 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  58.9 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  33.79 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  33.79 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.79 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  33.79 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  33.79 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.25 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  34.25 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  33.79 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.79 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.63 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.18 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  28.96 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  28.89 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  31.55 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.41 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.19 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  30.84 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  29.91 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.47 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  29.87 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.89 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.09 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.86 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.25 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  35.91 
 
 		 201 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.71 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.85 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  37.4 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.49 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  35.34 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.55 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  35.77 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.6 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  36.59 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.01 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  36.59 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  36.59 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  34.96 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  40.2 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>