56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3305 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  90.71 
 
 		 280 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  90.71 
 
 		 280 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  60.69 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  53.07 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  30.71 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  29.63 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  31.11 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  28.9 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  28.9 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  29.43 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  29.06 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  29.06 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  28.85 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  28.3 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  27.38 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  28.24 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  26.96 
 
 		 307 aa  95.9  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  25 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  29.37 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  28.2 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  28.97 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  19.91 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  25.85 
 
 		 497 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.88 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.88 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.88 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  23.88 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.88 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.88 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  27.54 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  23.88 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  25.36 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  23.51 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  24.58 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  26.39 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  22.77 
 
 		 491 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  27.21 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0842  MltA-interacting MipA family protein  32.2 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00913257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  24.31 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  23.36 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  24.31 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  24.31 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  26.76 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>