More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3516 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 554 aa  666    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  66.37 
 
 		 562 aa  789    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 554 aa  666    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 554 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 556 aa  674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 569 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 554 aa  749    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 567 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 566 aa  700    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 554 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 580 aa  842    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 561 aa  708    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 560 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 556 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 781 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 556 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 569 aa  729    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 569 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 551 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 551 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 555 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 582 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  61.75 
 
 		 564 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 569 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 569 aa  774    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 555 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 553 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 557 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 565 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 559 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  61.2 
 
 		 567 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 569 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 596 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 566 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 569 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  65.85 
 
 		 572 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 558 aa  728    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 569 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 569 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 		 553 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  67.99 
 
 		 568 aa  785    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 554 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 540 aa  702    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 569 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 569 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 567 aa  734    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 565 aa  722    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 		 555 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 554 aa  666    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 569 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 778 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 		 561 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 705 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  64.43 
 
 		 563 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 565 aa  687    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 552 aa  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 554 aa  665    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 590 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 559 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 579 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 569 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 569 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 555 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 556 aa  672    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 561 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 777 aa  650    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 576 aa  690    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 555 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  66.97 
 
 		 558 aa  757    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3674  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 606 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620823  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 580 aa  653    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 559 aa  668    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 573 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 555 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 561 aa  823    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 555 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 559 aa  683    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 569 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 558 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  67.26 
 
 		 568 aa  803    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 555 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 		 552 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 552 aa  714    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  67.33 
 
 		 565 aa  803    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 555 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 556 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 556 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 555 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 555 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 		 589 aa  805    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 555 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 569 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 556 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 569 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 567 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 554 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 564 aa  1172    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 556 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  67.26 
 
 		 570 aa  788    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 565 aa  755    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>