More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2768 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
354 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.99 
 
 
355 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  51 
 
 
365 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.29 
 
 
353 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.01 
 
 
353 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.86 
 
 
356 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  51.66 
 
 
341 aa  352  5e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.7 
 
 
354 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.07 
 
 
354 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.23 
 
 
354 aa  342  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.26 
 
 
353 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.05 
 
 
354 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.58 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.74 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  45.35 
 
 
354 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.63 
 
 
357 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.69 
 
 
351 aa  331  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 
351 aa  325  6e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.99 
 
 
547 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.03 
 
 
354 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  41.62 
 
 
358 aa  322  9.000000000000001e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  45.19 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.61 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.02 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.81 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  41.95 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.07 
 
 
375 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.48 
 
 
363 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.35 
 
 
374 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.63 
 
 
372 aa  297  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.15 
 
 
355 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.04 
 
 
385 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.04 
 
 
385 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 
376 aa  288  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  39.32 
 
 
380 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 
387 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  42.12 
 
 
354 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.57 
 
 
360 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.6 
 
 
379 aa  274  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.68 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.53 
 
 
353 aa  266  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  37.46 
 
 
354 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.26 
 
 
348 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  37.18 
 
 
354 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.55 
 
 
352 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.55 
 
 
356 aa  258  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.64 
 
 
383 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.37 
 
 
352 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.84 
 
 
352 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.66 
 
 
372 aa  251  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.32 
 
 
382 aa  249  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.59 
 
 
381 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.59 
 
 
381 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.99 
 
 
368 aa  248  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.52 
 
 
395 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 
354 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.83 
 
 
381 aa  245  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  35.81 
 
 
367 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.94 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.1 
 
 
357 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.27 
 
 
332 aa  228  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.26 
 
 
360 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.15 
 
 
387 aa  225  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.76 
 
 
327 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.78 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.27 
 
 
351 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.47 
 
 
355 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.76 
 
 
325 aa  206  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.15 
 
 
291 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.21 
 
 
316 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.97 
 
 
357 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.54 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.61 
 
 
325 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.25 
 
 
333 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.04 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.66 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.75 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.66 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.68 
 
 
314 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
325 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
325 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  27.74 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
325 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.54 
 
 
315 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.03 
 
 
314 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  33 
 
 
322 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.91 
 
 
316 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.54 
 
 
325 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.74 
 
 
316 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.66 
 
 
320 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.44 
 
 
316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.66 
 
 
316 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  30.66 
 
 
316 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.33 
 
 
321 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  30.66 
 
 
320 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.06 
 
 
357 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.25 
 
 
316 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.66 
 
 
316 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>