262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1505 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1286    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  50.52 
 
 		 313 aa  262  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  51.6 
 
 		 306 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  49.31 
 
 		 329 aa  253  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  51.62 
 
 		 304 aa  243  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 325 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  49.64 
 
 		 298 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  47.97 
 
 		 298 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  47.97 
 
 		 298 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  47.97 
 
 		 298 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  49.28 
 
 		 298 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  44.11 
 
 		 309 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  47.72 
 
 		 330 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 339 aa  230  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  50.36 
 
 		 336 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  47.64 
 
 		 298 aa  228  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 298 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 298 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 298 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 298 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 298 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 298 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  50 
 
 		 305 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 302 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 302 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  46.62 
 
 		 298 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  47.12 
 
 		 303 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  46.81 
 
 		 295 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 295 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 299 aa  220  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  47.94 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  45.59 
 
 		 299 aa  217  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 295 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  42.91 
 
 		 303 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  45.76 
 
 		 299 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  48.4 
 
 		 296 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  45.26 
 
 		 315 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  48.12 
 
 		 296 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  46.45 
 
 		 294 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  46.24 
 
 		 312 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  48.75 
 
 		 296 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  47.29 
 
 		 293 aa  211  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  45.26 
 
 		 330 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 300 aa  209  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  45.23 
 
 		 302 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 299 aa  203  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 298 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 292 aa  201  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 293 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.58 
 
 		 294 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 294 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 294 aa  198  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 292 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.58 
 
 		 294 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 299 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  41.03 
 
 		 311 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.13 
 
 		 297 aa  196  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 292 aa  194  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 		 305 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  41.9 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  45.08 
 
 		 299 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 		 297 aa  191  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  40.86 
 
 		 317 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.76 
 
 		 299 aa  189  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 306 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 300 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.22 
 
 		 584 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 289 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 299 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 		 327 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.4 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  34.32 
 
 		 329 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.68 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  36.27 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  34.56 
 
 		 325 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.64 
 
 		 289 aa  164  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  35.42 
 
 		 323 aa  163  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  34.23 
 
 		 325 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  35.66 
 
 		 323 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 363 aa  160  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  32.59 
 
 		 329 aa  160  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  34.36 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  34.95 
 
 		 337 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 		 287 aa  158  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  34.01 
 
 		 322 aa  158  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 329 aa  157  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  30.09 
 
 		 341 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  31.83 
 
 		 324 aa  154  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  35.34 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  33.02 
 
 		 323 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.02 
 
 		 323 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  33.67 
 
 		 323 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.02 
 
 		 323 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.02 
 
 		 323 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.02 
 
 		 323 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  32.79 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.02 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>