More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1602 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  85.74 
 
 		 554 aa  1012    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  821    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  70.04 
 
 		 554 aa  820    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  85.92 
 
 		 554 aa  1012    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  61.32 
 
 		 563 aa  701    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  70.22 
 
 		 554 aa  824    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  87.18 
 
 		 554 aa  1021    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  69.68 
 
 		 554 aa  814    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  826    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  69.68 
 
 		 554 aa  816    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  60.78 
 
 		 564 aa  697    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  69.13 
 
 		 554 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  69.49 
 
 		 554 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  61.14 
 
 		 563 aa  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  86.28 
 
 		 554 aa  1016    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  821    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  69.68 
 
 		 554 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  86.1 
 
 		 554 aa  1013    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  85.56 
 
 		 554 aa  1007    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  61.5 
 
 		 563 aa  704    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  65.95 
 
 		 558 aa  765    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  84.38 
 
 		 557 aa  997    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  70.4 
 
 		 554 aa  823    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  67.33 
 
 		 555 aa  810    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  69.68 
 
 		 554 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  68.95 
 
 		 554 aa  803    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  86.28 
 
 		 554 aa  1016    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  86.28 
 
 		 555 aa  1016    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  67.27 
 
 		 556 aa  798    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  69.68 
 
 		 554 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  65.16 
 
 		 562 aa  770    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  67.93 
 
 		 556 aa  815    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  70.04 
 
 		 554 aa  821    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  85.56 
 
 		 553 aa  1003    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  69.49 
 
 		 554 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  87.55 
 
 		 554 aa  1025    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  87.73 
 
 		 554 aa  1029    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  100 
 
 		 554 aa  1152    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  801    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  70.4 
 
 		 554 aa  824    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  69.31 
 
 		 554 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  820    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  84.84 
 
 		 552 aa  990    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  87.36 
 
 		 554 aa  1023    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  69.68 
 
 		 554 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  83.75 
 
 		 554 aa  983    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  72.56 
 
 		 556 aa  843    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  69.13 
 
 		 554 aa  825    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  821    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  68.95 
 
 		 554 aa  803    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  69.49 
 
 		 554 aa  815    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  69.68 
 
 		 554 aa  797    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  51.54 
 
 		 596 aa  590  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  50.92 
 
 		 592 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  48.97 
 
 		 571 aa  547  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  49.91 
 
 		 573 aa  527  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  47.6 
 
 		 638 aa  494  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  44.67 
 
 		 537 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  40.51 
 
 		 543 aa  363  4e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  39.65 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.26 
 
 		 528 aa  325  9e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  40.57 
 
 		 530 aa  310  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  37.16 
 
 		 537 aa  293  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  36.91 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  35.94 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.27 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 		 510 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 		 510 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 		 510 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 		 510 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 		 510 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 		 510 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.73 
 
 		 510 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  32.62 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.83 
 
 		 660 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.19 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.81 
 
 		 660 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.42 
 
 		 666 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.6 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.16 
 
 		 678 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  31.94 
 
 		 482 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.67 
 
 		 536 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.56 
 
 		 607 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  29.71 
 
 		 599 aa  196  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.91 
 
 		 664 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.52 
 
 		 606 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0140  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.99 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0103295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.69 
 
 		 624 aa  193  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.34 
 
 		 619 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.02 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.89 
 
 		 633 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1299  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.06 
 
 		 613 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294849  normal  0.177591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.75 
 
 		 678 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.88 
 
 		 613 aa  187  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.02 
 
 		 635 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  29.67 
 
 		 592 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1627  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.46 
 
 		 615 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.52 
 
 		 591 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>