More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2560 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  65.14 
 
 
529 aa  751    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.37 
 
 
931 aa  959    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  100 
 
 
989 aa  2050    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  51.17 
 
 
957 aa  975    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.63 
 
 
944 aa  999    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.98 
 
 
941 aa  993    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.27 
 
 
938 aa  1002    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.26 
 
 
937 aa  965    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  52.07 
 
 
944 aa  996    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.27 
 
 
938 aa  1003    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  53.81 
 
 
955 aa  1027    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  51.96 
 
 
943 aa  994    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.05 
 
 
938 aa  1001    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  50.32 
 
 
942 aa  906    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.02 
 
 
944 aa  995    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.64 
 
 
944 aa  994    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.35 
 
 
1001 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.89 
 
 
931 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.2 
 
 
918 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.24 
 
 
982 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.5 
 
 
868 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.63 
 
 
864 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.65 
 
 
870 aa  270  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.1 
 
 
847 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.11 
 
 
641 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.92 
 
 
845 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.07 
 
 
882 aa  237  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.45 
 
 
861 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.36 
 
 
880 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.06 
 
 
838 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.6 
 
 
822 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.97 
 
 
870 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  29.79 
 
 
691 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 
648 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.67 
 
 
689 aa  108  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  28.83 
 
 
693 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.31 
 
 
660 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.55 
 
 
822 aa  100  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.88 
 
 
910 aa  97.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.08 
 
 
631 aa  95.9  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.41 
 
 
673 aa  93.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.92 
 
 
678 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.94 
 
 
652 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  27.57 
 
 
656 aa  92  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.76 
 
 
652 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  27.04 
 
 
656 aa  90.1  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.1 
 
 
652 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.78 
 
 
654 aa  89.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.64 
 
 
824 aa  88.2  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.33 
 
 
692 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  24.37 
 
 
655 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  24.53 
 
 
654 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 
813 aa  87.4  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.88 
 
 
692 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  23.76 
 
 
654 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.19 
 
 
654 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25 
 
 
691 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.72 
 
 
688 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.6 
 
 
655 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  25.94 
 
 
655 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.24 
 
 
648 aa  84.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  21.85 
 
 
594 aa  84  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.55 
 
 
682 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.28 
 
 
588 aa  83.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.83 
 
 
680 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.33 
 
 
686 aa  82  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.44 
 
 
686 aa  82  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.89 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.72 
 
 
630 aa  82  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.94 
 
 
642 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.85 
 
 
924 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  26.1 
 
 
678 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.91 
 
 
682 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13777  predicted protein  29.77 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.98 
 
 
705 aa  78.2  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.87 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.71 
 
 
670 aa  77.4  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.67 
 
 
672 aa  77.4  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  22.01 
 
 
841 aa  77  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.16 
 
 
697 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.5 
 
 
621 aa  76.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.91 
 
 
807 aa  76.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.47 
 
 
708 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.63 
 
 
674 aa  74.7  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  27.57 
 
 
685 aa  74.7  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.12 
 
 
720 aa  75.1  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.35 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0507  Acylaminoacyl-peptidase  25.85 
 
 
591 aa  74.3  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.77 
 
 
674 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  21.95 
 
 
596 aa  74.3  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.55 
 
 
677 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.04 
 
 
645 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0440  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.66 
 
 
536 aa  73.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  23.78 
 
 
657 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.44 
 
 
688 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  24.52 
 
 
698 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 
683 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.41 
 
 
674 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.15 
 
 
645 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.55 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>