More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0010 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0010  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
317 aa  657  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  42.73 
 
 
339 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  42.73 
 
 
339 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  42.73 
 
 
339 aa  255  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0131  A/G-specific adenine glycosylase  37.54 
 
 
342 aa  236  5e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  39.88 
 
 
353 aa  221  2e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  43.38 
 
 
352 aa  219  4e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.37419e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.36 
 
 
363 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.33 
 
 
360 aa  214  2e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 
370 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.74 
 
 
368 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  39.13 
 
 
368 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 
368 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 
368 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.8 
 
 
368 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 
368 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.06 
 
 
368 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.06 
 
 
368 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.8 
 
 
368 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.8 
 
 
368 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.8 
 
 
368 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.8 
 
 
368 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.89 
 
 
370 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  38.37 
 
 
330 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 
382 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  36.21 
 
 
345 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.35 
 
 
363 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  36.21 
 
 
345 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  36.79 
 
 
362 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39 
 
 
375 aa  201  1e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.81 
 
 
352 aa  201  1e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 
360 aa  201  2e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.07 
 
 
348 aa  199  4e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.81 
 
 
352 aa  199  4e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  36.83 
 
 
382 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  46.03 
 
 
344 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.01 
 
 
386 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  37.32 
 
 
362 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  39.66 
 
 
368 aa  198  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  38.41 
 
 
354 aa  197  1e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  39.93 
 
 
355 aa  198  1e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  35.45 
 
 
383 aa  198  1e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  38.41 
 
 
354 aa  197  2e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.8 
 
 
345 aa  197  2e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.61825e-14  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  39.54 
 
 
381 aa  197  2e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  40.34 
 
 
368 aa  197  2e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  37.28 
 
 
355 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  36.69 
 
 
355 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.08141e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  36.87 
 
 
368 aa  196  4e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 
353 aa  196  5e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 
355 aa  196  5e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  36.19 
 
 
347 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  43.62 
 
 
381 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  38.93 
 
 
354 aa  195  8e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  41.6 
 
 
356 aa  195  8e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  35.49 
 
 
365 aa  195  8e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  40.27 
 
 
370 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  4.11331e-05  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  36.55 
 
 
368 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  36.83 
 
 
324 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 
355 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  41.44 
 
 
370 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.58 
 
 
361 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  41.42 
 
 
357 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  37.92 
 
 
369 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.85 
 
 
354 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  39.46 
 
 
352 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  32.77 
 
 
388 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.11 
 
 
372 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.36828e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.54 
 
 
372 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.1452e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.13 
 
 
355 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  4.89397e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.54 
 
 
372 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  38.28 
 
 
354 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  41.63 
 
 
344 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  37.46 
 
 
353 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.9513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  37.92 
 
 
353 aa  190  3e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.04 
 
 
357 aa  190  3e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  37.76 
 
 
355 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  37.76 
 
 
355 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 
355 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  41.18 
 
 
353 aa  189  6e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  38.91 
 
 
360 aa  189  6e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  38.97 
 
 
350 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  41.25 
 
 
384 aa  188  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  38.57 
 
 
350 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  38.91 
 
 
372 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  7.64149e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  38.57 
 
 
350 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  38.57 
 
 
350 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  38.62 
 
 
360 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  38.61 
 
 
354 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.62379e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  38.91 
 
 
419 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  38.97 
 
 
350 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  38.97 
 
 
360 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  38.97 
 
 
350 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  40 
 
 
363 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 
350 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  38.26 
 
 
363 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  38.97 
 
 
350 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.97 
 
 
350 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.91 
 
 
368 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  37.34 
 
 
362 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>