41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0204 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  37.88 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  34.47 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  33.77 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  29.84 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  29.84 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  28.97 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.1 
 
 		 182 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  24.88 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  26.58 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  28.03 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  27.54 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  27.54 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  27.54 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  28.46 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  27.23 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  28.8 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  27.63 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  32.81 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  25.66 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.07 
 
 		 174 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.25 
 
 		 147 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  25.46 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  26.46 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  26.62 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  32.17 
 
 		 224 aa  45.4  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  32.17 
 
 		 224 aa  45.4  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.58 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  32.22 
 
 		 425 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  25.93 
 
 		 399 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  29.35 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  37.66 
 
 		 173 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  29.1 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  26.98 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  35.71 
 
 		 382 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  33.67 
 
 		 383 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>