160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4175 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  99.15 
 
 		 498 aa  947    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  99.57 
 
 		 498 aa  951    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  65.52 
 
 		 499 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  85.26 
 
 		 498 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  99.15 
 
 		 498 aa  947    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  82.05 
 
 		 498 aa  768    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  99.15 
 
 		 506 aa  947    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  99.36 
 
 		 498 aa  949    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  65.52 
 
 		 499 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  85.47 
 
 		 498 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  99.15 
 
 		 498 aa  947    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  98.93 
 
 		 498 aa  948    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  100 
 
 		 468 aa  953    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  85.04 
 
 		 498 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  98.72 
 
 		 498 aa  944    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  85.47 
 
 		 498 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  85.47 
 
 		 498 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  66.88 
 
 		 499 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  65.95 
 
 		 498 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  67.9 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  67.69 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  67.9 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  67.67 
 
 		 523 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  43.71 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  43.06 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  42.63 
 
 		 552 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  42.51 
 
 		 546 aa  355  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  47.75 
 
 		 530 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  49.62 
 
 		 543 aa  260  4e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.79 
 
 		 526 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.15 
 
 		 528 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  42.7 
 
 		 560 aa  226  6e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  47.51 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  46.62 
 
 		 509 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  46.24 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.34 
 
 		 375 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  43.14 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  37.97 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  42.19 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.43 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  38.58 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.19 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  43.08 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  40.44 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.23 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.48 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  36.43 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.35 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.91 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.14 
 
 		 387 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.42 
 
 		 383 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  36.55 
 
 		 368 aa  100  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  37.93 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  36 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  38.36 
 
 		 368 aa  95.9  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  37.01 
 
 		 368 aa  94  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.67 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  30.41 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  27.65 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.56 
 
 		 325 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  23.64 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  23.79 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  25.1 
 
 		 312 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  25.69 
 
 		 317 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1527  Nif-specific regulatory protein  26.09 
 
 		 545 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.87 
 
 		 334 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1244  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  26.09 
 
 		 545 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.771278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  26.38 
 
 		 320 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  26.38 
 
 		 320 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  26.38 
 
 		 320 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  23.53 
 
 		 315 aa  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  24.34 
 
 		 318 aa  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  23.84 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.68 
 
 		 319 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  26.07 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  32.45 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.39 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.84 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  26.3 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  25.74 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.4 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  28.76 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.62 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33440  sigma54-dependent activator protein  28.57 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  29.22 
 
 		 329 aa  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.27 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  32.24 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.02 
 
 		 321 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  25.98 
 
 		 320 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  24.71 
 
 		 309 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.74 
 
 		 338 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.57 
 
 		 313 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  24.51 
 
 		 302 aa  47  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.08 
 
 		 331 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>