37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2159 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  41.61 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  41.86 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  41.28 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  41.16 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  41.16 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  41.54 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  40.07 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  41.51 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  41.13 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  40.75 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  57.64 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  39.21 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  39.21 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  39.62 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  54.23 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  48.32 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1152  hypothetical protein  50.79 
 
 		 400 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.303869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1231  hypothetical protein  49.54 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.446954  normal  0.253357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  29.59 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  44.21 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5241  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3052  hypothetical protein  33.72 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.833159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  85.19 
 
 		 57 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  29.05 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  36.62 
 
 		 197 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  33.61 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1425  hypothetical protein  31.36 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  36.11 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  28.47 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  28.47 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  27.78 
 
 		 344 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  27.78 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  35.82 
 
 		 86 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  31.88 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  30.59 
 
 		 431 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>