36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0770 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  97.95 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  97.95 
 
 		 249 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  97.54 
 
 		 249 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  68.18 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  66.18 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  65.82 
 
 		 278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  65.36 
 
 		 285 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  65.33 
 
 		 278 aa  337  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  64.64 
 
 		 285 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  64.29 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  65.82 
 
 		 278 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  65.82 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  57.46 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  40.31 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  39.54 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  56.06 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  42.42 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  25.7 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3828  hypothetical protein  29.09 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  27.5 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  44.64 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  45.61 
 
 		 455 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  47.37 
 
 		 80 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  32.58 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  38.89 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  26.83 
 
 		 431 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  38.24 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  38.89 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  33.82 
 
 		 411 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  31.82 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1550  hypothetical protein  30.7 
 
 		 398 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.584336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  35.09 
 
 		 344 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  30.51 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2955  hypothetical protein  34.78 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1425  hypothetical protein  21.2 
 
 		 328 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>