15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3448 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2069  hypothetical protein  57.07 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  29.27 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  32.05 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  43.28 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  29.36 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  29.36 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2872  hypothetical protein  28.78 
 
 		 314 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  29.36 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  32.58 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  29.67 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1672  gp60  31.34 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0382632  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1033  gp60  31.34 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>