13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1672 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1672  gp60  100 
 
 		 311 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0382632  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1033  gp60  97.75 
 
 		 311 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  64.44 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1036  hypothetical protein  65.32 
 
 		 180 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215145  normal  0.0235886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  23.17 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  29.36 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  27.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  31.34 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2069  hypothetical protein  31.4 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  33.82 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  29.25 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7350  hypothetical protein  30.19 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  40.82 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>