34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3117 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7350  hypothetical protein  37.84 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  31.19 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  31.19 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  31.19 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  39.13 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  30.28 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  39.13 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  39.13 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  36.96 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  32.58 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  32.58 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  32.58 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  31.52 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  31.52 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  31.52 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  33.72 
 
 		 274 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  32.93 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  28.07 
 
 		 318 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1831  hypothetical protein  37.14 
 
 		 403 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0214097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  29.21 
 
 		 294 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3007  hypothetical protein  30.68 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  34.62 
 
 		 344 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  38.24 
 
 		 326 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  30.59 
 
 		 352 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  30.36 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05541  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.559831  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4654  hypothetical protein  26.87 
 
 		 392 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467164  normal  0.232451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>