27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3327 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  691    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  46.46 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  27.97 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  26.52 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  28.89 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  38.24 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2955  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7350  hypothetical protein  32.48 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  27.11 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  24.39 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  27.4 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  34.38 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  31.51 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  31.51 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  31.51 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  32.35 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  36 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  35.14 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  24.41 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  29.73 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  29.73 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  35.16 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3123  hypothetical protein  23.08 
 
 		 246 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00465086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>