29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1970 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  100 
 
 		 285 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  99.3 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  96.84 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  66.67 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  66.32 
 
 		 278 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  64.95 
 
 		 263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  63.39 
 
 		 278 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  64.21 
 
 		 249 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  64.21 
 
 		 249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  63.86 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  65.64 
 
 		 278 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  65.64 
 
 		 278 aa  333  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  63.57 
 
 		 244 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  41.86 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  39.86 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  40.7 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  63.64 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  31.52 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  51.02 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  85.19 
 
 		 57 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1425  hypothetical protein  36.92 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  35.82 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  30.69 
 
 		 431 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  41.94 
 
 		 411 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  31.88 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  24.6 
 
 		 333 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  31.51 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  38.03 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>