44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1139 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  100 
 
 		 326 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2249  hypothetical protein  66.36 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  43.82 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  57.55 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  56.2 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  55.47 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  55.47 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  48.32 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  56.06 
 
 		 244 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  45.33 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  40.7 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  40.7 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  40.12 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  43.66 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  43.66 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  54.64 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  43.66 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  43.66 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  40.13 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  50.55 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  36.47 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  43.48 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  30.68 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  34.75 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  30.68 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3828  hypothetical protein  25.82 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  38.89 
 
 		 411 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  27.66 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0348  hypothetical protein  36.47 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.13978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  81.48 
 
 		 57 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  39.19 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  28.48 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  32.29 
 
 		 455 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  37.68 
 
 		 86 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  38.24 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  39.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  43.14 
 
 		 80 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  38.57 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  36 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  25.45 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  26.14 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2955  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  29.76 
 
 		 243 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>