17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0383 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  45.87 
 
 		 344 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  26.47 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  25.74 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  25.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  25.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  25.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  25.76 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  28.57 
 
 		 326 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  24.6 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  24.6 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  24.6 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  27.78 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  29.49 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05541  hypothetical protein  32.94 
 
 		 134 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.559831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>