32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1691 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  834    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2339  hypothetical protein  52.03 
 
 		 300 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444343  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  57.5 
 
 		 255 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2810  hypothetical protein  42.34 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.914364  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2260  hypothetical protein  43.21 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  34.67 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  50 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  50 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  50 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  50 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  50 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  48.15 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  43.33 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  43.33 
 
 		 80 aa  53.5  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  43.33 
 
 		 313 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 249 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2955  hypothetical protein  41.27 
 
 		 208 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  38.89 
 
 		 326 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  40.58 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  36.11 
 
 		 274 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  38.89 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  38.89 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  38.89 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  32.08 
 
 		 243 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1032  gp69  37.18 
 
 		 86 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  33.82 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  39.13 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  33.82 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  33.82 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  33.82 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  35.16 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>