40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3612 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  98.8 
 
 
249 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  97.19 
 
 
249 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  97.54 
 
 
244 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  68.77 
 
 
263 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  66.79 
 
 
278 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  66.43 
 
 
278 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  66.67 
 
 
278 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  66.32 
 
 
285 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  65.96 
 
 
285 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  65.26 
 
 
285 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  66.43 
 
 
278 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  66.07 
 
 
278 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  58.99 
 
 
249 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  41.04 
 
 
274 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  41.06 
 
 
251 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  56.2 
 
 
326 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  25.7 
 
 
294 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  42.42 
 
 
313 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  27.34 
 
 
197 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3828  hypothetical protein  29.09 
 
 
285 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  44.64 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  45.61 
 
 
455 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  29.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  85.19 
 
 
57 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  25.1 
 
 
431 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  38.89 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  29.73 
 
 
344 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  38.24 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  38.89 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  31.82 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  26.04 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  33.82 
 
 
411 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  29.85 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  28.32 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  28.32 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2955  hypothetical protein  34.78 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1550  hypothetical protein  30.7 
 
 
398 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.584336  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  32.47 
 
 
352 aa  42  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>