25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0244 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  100 
 
 		 313 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  98.73 
 
 		 455 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  65.43 
 
 		 315 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  66.67 
 
 		 320 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  67.86 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  47.95 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  43.33 
 
 		 411 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  47.37 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  47.37 
 
 		 249 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  47.37 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  47.37 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  36.92 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  38.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  38.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  38.46 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  38.6 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  38.6 
 
 		 278 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2872  hypothetical protein  36.62 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  38.6 
 
 		 278 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  43.48 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  38.46 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  39.68 
 
 		 255 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  43.14 
 
 		 326 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>