40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1259 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  100 
 
 		 315 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  90.94 
 
 		 320 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  89.49 
 
 		 295 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  59.33 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  61.27 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  63.64 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  61.27 
 
 		 321 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  61.27 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  65.43 
 
 		 80 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  65.82 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  40.54 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  37.93 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  35.06 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  35.06 
 
 		 274 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  35.94 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  35.94 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  35.94 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  41.35 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  40.45 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  38.83 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  31.36 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1152  hypothetical protein  37.37 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.303869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  28.47 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 411 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  26.35 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  28.24 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  44.29 
 
 		 86 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  34.25 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  34.25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  34.25 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  34.25 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  34.25 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  38.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  39.19 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  38.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  38.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1831  hypothetical protein  31.71 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0214097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>