28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6266 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  678    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4654  hypothetical protein  40.51 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467164  normal  0.232451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0388  hypothetical protein  38.46 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0508066  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1831  hypothetical protein  35.71 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0214097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05541  hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.559831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  23.18 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  36.23 
 
 		 251 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  39.71 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  28.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  28.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  28.74 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  31.88 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  31.88 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  31.88 
 
 		 285 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  32.88 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  32.35 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  26.14 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  27.96 
 
 		 197 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  31.88 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  26.04 
 
 		 249 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  32.35 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  26.04 
 
 		 249 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  26.04 
 
 		 249 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  35 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>