33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3746 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2787  hypothetical protein  98.37 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  66.67 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  66.67 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  36.96 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  29.05 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  31.34 
 
 		 86 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  33.71 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4654  hypothetical protein  34.95 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467164  normal  0.232451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  37.31 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  21.97 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1032  gp69  36.84 
 
 		 86 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110113  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  32.93 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  27.63 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  28 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1161  hypothetical protein  28.95 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000610195  hitchhiker  1.74313e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3166  hypothetical protein  28.95 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168095  hitchhiker  1.83761e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1833  hypothetical protein  28.95 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000938078  decreased coverage  0.0000000000000142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1756  hypothetical protein  28.95 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000208763  hitchhiker  0.000309878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  29.21 
 
 		 352 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  25.45 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  27.63 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  43.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  30.51 
 
 		 244 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  29.85 
 
 		 249 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  29.85 
 
 		 249 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  29.85 
 
 		 249 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>