27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1441 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  66.67 
 
 
269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2787  hypothetical protein  66.81 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  29.35 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  29.35 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  29.35 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  28.26 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  35.29 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  28.26 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  35.29 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  28.47 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  31.17 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  36.92 
 
 
86 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  32.84 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  30.34 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  30.43 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  28.41 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1161  hypothetical protein  33.82 
 
 
346 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000610195  hitchhiker  1.74313e-19 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1032  gp69  38.89 
 
 
86 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1756  hypothetical protein  33.82 
 
 
346 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000208763  hitchhiker  0.000309878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1833  hypothetical protein  33.82 
 
 
346 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000938078  decreased coverage  0.0000000000000142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3166  hypothetical protein  33.82 
 
 
346 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168095  hitchhiker  1.83761e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1424  hypothetical protein  33.82 
 
 
346 aa  42.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000647659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  32.2 
 
 
411 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 
249 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>