29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1424 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3166  hypothetical protein  97.98 
 
 
346 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168095  hitchhiker  1.83761e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1424  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000647659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1161  hypothetical protein  99.71 
 
 
346 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000610195  hitchhiker  1.74313e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1833  hypothetical protein  97.98 
 
 
346 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000938078  decreased coverage  0.0000000000000142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1756  hypothetical protein  98.55 
 
 
346 aa  705    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000208763  hitchhiker  0.000309878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2808  hypothetical protein  82.45 
 
 
345 aa  316  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1510  hypothetical protein  82.45 
 
 
345 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.403027  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2209  hypothetical protein  72.17 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00285391  decreased coverage  5.0069399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  49.31 
 
 
332 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2262  Pyocin large subunit-like protein  48.76 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000537713  unclonable  0.00000275213 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  38.96 
 
 
268 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0517  primosomal protein DnaI  57.14 
 
 
165 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4958  primosomal protein DnaI  58.57 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142503  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4865  primosomal protein DnaI  58.57 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4798  primosomal protein DnaI  58.57 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.841736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4952  primosomal protein DnaI  58.57 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4899  primosomal protein DnaI  58.57 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.541302  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3007  hypothetical protein  30.48 
 
 
247 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5875  primosomal protein DnaI  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000199984  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04205  hypothetical protein  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4902  primosomal protein DnaI  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04239  primosomal protein I  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000479477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4907  primosomal protein DnaI  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108002  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3693  primosomal protein DnaI  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000682768  hitchhiker  0.0041553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4955  primosomal protein DnaI  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3635  primosomal protein 1  51.81 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4594  primosomal protein DnaI  50.6 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  30.53 
 
 
294 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  37.31 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>