15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2457 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  42.19 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1231  hypothetical protein  31.48 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.446954  normal  0.253357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  44.21 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1152  hypothetical protein  43.96 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.303869 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  33.03 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  31.78 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  32.63 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3701  hypothetical protein  23.33 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  27.66 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  29.78 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1110  hypothetical protein  30.48 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.783953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  33.75 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  28.09 
 
 		 398 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  27.96 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>