17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3348 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  56.14 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  48.44 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  45 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  44.17 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  45 
 
 		 398 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  46.6 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2074  hypothetical protein  31.97 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3352  hypothetical protein  31.97 
 
 		 220 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.197712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1745  hypothetical protein  39.05 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.511384 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3612  hypothetical protein  31.29 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6014  hypothetical protein  28.83 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  29.91 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2402  hypothetical protein  56.76 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  33.75 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3701  hypothetical protein  32.5 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>