13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2383 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  810    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  48.41 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3701  hypothetical protein  45.14 
 
 
342 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  47.62 
 
 
325 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  39.58 
 
 
362 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  36.09 
 
 
353 aa  84  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  36.09 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  37.62 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  29.31 
 
 
285 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  30.3 
 
 
296 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7128  hypothetical protein  32.41 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3082  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484609  hitchhiker  0.000108823 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3776  hypothetical protein  31.69 
 
 
217 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>