13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3701 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3701  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  690    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  56.57 
 
 
398 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  26.5 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  23.33 
 
 
285 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  31.03 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  32.5 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  35 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  31.37 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  32.32 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  27.88 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3957  hypothetical protein  37.36 
 
 
264 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2904  hypothetical protein  29.03 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  32.97 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0779925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>