12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3957 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3957  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2260  hypothetical protein  33.56 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0148  hypothetical protein  40.26 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0166  hypothetical protein  38.96 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2904  hypothetical protein  41.77 
 
 
332 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1076  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  71.43 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1038  hypothetical protein  33.77 
 
 
299 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3701  hypothetical protein  37.36 
 
 
342 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1110  hypothetical protein  23.16 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.783953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3052  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.833159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1001  hypothetical protein  32.39 
 
 
394 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>