11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2904 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2904  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3051  hypothetical protein  46.97 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.307342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3957  hypothetical protein  41.77 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3493  hypothetical protein  31.82 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1350  hypothetical protein  32.89 
 
 		 420 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.776817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1110  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.783953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1452  hypothetical protein  34.67 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.309909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1874  hypothetical protein  32.08 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2260  hypothetical protein  32.47 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3701  hypothetical protein  29.52 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3052  hypothetical protein  35.62 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.833159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>