12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1874 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  28.8 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8233  protein of unknown function DUF1376  62.22 
 
 		 202 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  32.59 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0659  hypothetical protein  28.03 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  31.43 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1835  hypothetical protein  36 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1736  hypothetical protein  33.72 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3052  hypothetical protein  33.73 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.833159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1350  hypothetical protein  31.68 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.776817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2904  hypothetical protein  32.08 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.64897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>