15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1276 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  627  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  95.36 
 
 		 353 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  43.41 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  46.6 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  47.47 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  40.71 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3310  hypothetical protein  32.8 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.511384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6014  hypothetical protein  33.59 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  32.63 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1745  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  32.67 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2074  hypothetical protein  43.24 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3612  hypothetical protein  43.24 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3352  hypothetical protein  43.24 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.197712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>