16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2767 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  50.68 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  56.14 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  46.96 
 
 
353 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  46.09 
 
 
353 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  48.96 
 
 
302 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  48.33 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2074  hypothetical protein  41.9 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6014  hypothetical protein  47.56 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3612  hypothetical protein  47.56 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3352  hypothetical protein  47.56 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.197712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1745  hypothetical protein  39.05 
 
 
214 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3310  hypothetical protein  38.26 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.511384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  32.69 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  29 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3776  hypothetical protein  31.54 
 
 
217 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>