15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0136 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  734    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  94.9 
 
 		 353 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  45 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  42.57 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  45.16 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  37.69 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  33.61 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3310  hypothetical protein  33.09 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.511384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6014  hypothetical protein  33.82 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3612  hypothetical protein  31.71 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1745  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3352  hypothetical protein  38.18 
 
 		 220 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.197712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2074  hypothetical protein  42.68 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  33.03 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>